Laboratório Associado 01 - Genômica e Proteômica (UnB, Embrapa Cenargen)
- Responsável: Robert N. G. Miller
- Atividades do Laboratório junto ao INCT Colaboradores
Integrar dados do transcritoma de monocotiledôneas (arroz, milho, trigo, Musa e sorgo) submetidos a déficit hídrico, gerados por sequenciamento massal (Illumina–HiSeq) em projetos anteriores.
LA5, LA6, LA9 e LA11
Sequenciar e integrar transcritoma de genótipos tolerantes a seca de Musa spp., Arachis spp., e feijão-caupi submetidos a deficit hídrico combinado com estresse biótico (Meloidogyne spp. ou Mycosphaerella) em bioensaios.
LA5 e LA9
Sequenciar e integrar transcritoma de genótipos tolerantes a fungos de Musa submetidos a múltiplos estresses (Musa X Mycosphaerella musicola e Fusarium oxysporun).
Validar a expressão de genes-chave nas vias metabólicas de resposta das plantas a estresses combinados (bióticoxbiótico; bióticoxabiótico; abióticoxabiótico) por qRT-PCR.
LA3, LA5 e LA9
Sequenciar em plataforma Illumina fração de pequenos RNAs, e seus mRNA-alvos, e RNAs circulares de plantas (Arachis; Musa; soja; pitangueira; cajueiro) submetidas a estresses bióticos e/ou abióticos.
LA2, LA5, LA6 e LA9
Validar a função de genes de plantas identificados nos IDs 1 e 2 potencialmente envolvidos nos mecanismos de tolerância à seca em plantas de Arabidopsis, arroz ou setária via estratégias de superexpressão ou silenciamento.
LA2, LA3, LA4, LA5 e LA11
Organizar, manter e compartilhar um banco in vivo dos ativos de inovação obtidos no projeto compartilhado pelos membros do INCT.
Todos os LAs
- Descrição do Laboratório
O Laboratório (LA1) - Genômica e Proteômica realiza estudos voltados a prospecção e identificação de novos genes, sequências reguladoras e moléculas envolvidas com as respostas de resistência / tolerância de plantas a estresses bióticos e abióticos, visando à elucidação dos mecanismos moleculares das plantas que ocorrem em resposta aos diferentes estresses, combinados ou não. O LA1 tambem realiza-se a validação de função destes ativos em plantas-modelo.
- Linhas de Pesquisa
• Prospecção de genes/moléculas de interesse para o controle de pragas e da seca em germoplama silvestre de Musa spp.
• Prospecção de genes/moléculas- alvo em nematoides fitoparasitas (Meloidogyne sp.) e fungos fitopatogenicos (Pseudocercospora spp.) de interesse para o controle da praga
• Prospecção de pequenos RNAs (small RNAs) em genótipos de plantas resistentes/tolerantes a pragas e a seca que possam estar envolvidos com a respostas a estes estresses
• Prospecção de genes/moléculas que apresentam eficiência no controle de pragas e tolerância ao déficit hídrico simultaneamente (cross-stress).
• Validação dos ativos de inovação prospectados pela sua superexpressão ou silenciamento gênico em plantas-modelo para análise e validação de sua função
- Infraestrutura
Laboratório
O laboratório LA1 possui todos os equipamentos-padrão necessários para análises moleculares, com Certificado de Qualidade em Biossegurança (CQB) para desenvolvimento de atividades com organismos geneticamente modificadas (OGMs). O Departamento de Biologia Celular da UnB conta com dez laboratórios que abrangem diferentes áreas de pesquisa. A infraestrutura de equipamentos multiusuários disponível inclui sequenciadores automáticos de DNA, sequenciadores de proteínas, microscópios eletrônicos de varredura e transmissão, microscópio confocal, citômetro de fluxo, espectrômetros de massa, ultracentrífugas analíticas e preparativas, HPLC, fermentadores, centrífugas refrigeradas, PCR em tempo real, phosphoimager, microcalorímetro, espectrofotômetros de fluorescência e dicroísmo circular, espectrômetro de ressonância plasmônica, ultrafreezers de -80oC e outros equipamentos básicos utilizados na rotina dos laboratórios de pesquisa em biologia molecular e celular. O Departamento de Fitopatologia da UnB está equipado com microscópios, lupas, freezers, geladeiras, equipamentos para estudos de biologia molecular, estação biológica com local para trabalhos de campo, casas de vegetação, câmaras de crescimento Fitotron, e veículos de transporte.
- Nossa Equipe
Robert Neil Gerard Miller
Possui Graduação em Ciencias Biologicas - Manchester Metropolitan University, UK (1990), Mestrado em Proteção de Plantas - University Of Bath, UK (1991) e Doutorado em Biologia Molecular e Fitopatologia - University of Reading, UK (1995). Atualmente é Professor Associado I da Universidade de Brasilia (Campus Darcy Ribeiro, Departamento de Biologia Celular), orientando nos Programas de Pos-Graduaçao em Biologia Molecular, Fitopatologia e Biologia Microbiana. Atuou entre 2014 e 2016 como Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular (CAPES conceito 6). Atua como editor para os periódicos Annals of Botany e Tropical Plant Pathology, é coordenador de projetos nacionais e internacionais, principalmente nos seguintes temas:genômica funcional de plantas e microrganismos; busca de genes de resistência a estresse biotico em plantas; e caracterização de fungos fitopatogenicos e micotoxigenicos.
Eliane Ferreira Noronha
A Dra. Eliane F. Noronha graduou em Ciências Biológicas nível bacharelado pela Universidade de Brasília (1994), e posteriormente se especializou fazendo o Mestrado e Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular) desta mesma Instituição. Atualmente é professora Adjunto IV dedicação exclusiva na Universidade de Brasília. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Enzimologia e Estudos de Proteoma atuando principalmente nos seguintes temas: bioquímica de microrganismos, controle biológico, bioprospecção de enzimas de interesse biotecnológico, expressão heteróloga de proteínas de interesse biotecnológico.
Pós - Doutorado
• Gabriel Sergio Costa Alves - Lattes
• Fernando Campos de Assis Fonseca - Lattes
• Jose Dijair Antonino de Souza Junior - Lattes
Doutorado
• Leticia Dias de Freitas - Lattes
• Tatiana David Miranda Pinheiro - Lattes
• Erica Cristina Silva Rego - Lattes
Mestrado
• Amanda Cristina de Araújo - Lattes
- Contato
Robert Neil Gerard Miller
Laboratório de Microbiologia: Interação Planta-Praga, Bloco I-1-35/8,
Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular,
Universidade de Brasília, Campus Universitário Darcy Ribeiro, Asa Norte, 70910-900, Brasília, D.F., Brasil.
Email: robertmiller@unb.br
Fone: +55 61 3107 3048
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